报告题目：RNA可变剪切调控相关关系预测及调控网络构建
报告华体会网页版登陆入口：5月28日下午3：30
报告地点：校本部计算机楼313
报告人：尚学群教授(西北工业大学)
摘要：
RNA转录后可变剪切调控在哺乳动物基因调控及蛋白质多样性方面发挥着重要作用，是哺乳动物中基因转录后调控的最重要方式之一。当前在基因可变剪切水平预测和可变剪切差异水平分析方面的研究已经相对成熟，然而针对RNA可变剪切的后续调控关系和功能分析的研究相对较少。基因可变剪切调控因子与剪切事件的之间的关联关系分析为揭示可变剪切调控的内在机制提供了基本研究思路。针对基因转录后可变剪切调控相关关系预测不够准确的问题，我们提出了一种基于可变剪切事件相应读段数目的可变剪切调控相关关系预测方法（RMAS2）。考虑到可变剪切水平预测一般受样本测序深度影响，存在一定不确定性的问题，RMAS2模型直接基于可变剪切事件相应读段数目和可变剪切调控因子表达数据对可变剪切调控相关关系进行预测。实验表明，所提模型方法在可变剪切调控相关关系预测方面具有更好预测准确性和鲁邦性。
报告人简介：
尚学群，西北工业大学教授、博导。2005年获得德国博士学位。在德国留学期间，主要从事数据挖掘和数据库系统研究和开发，此间参加了欧盟的一个大型信息融合项目的研究。2005年11月西工大引进人才从德国回国工作。2009-2010年作为访问学者在美国RPI计算机系著名数据挖掘专家Zaki Mohammed教授领导的研究小组从事数据挖掘的研究。2013、2014、2015、2016、2017年分别在美国耶鲁大学病理学系、加州大学洛杉矶分校微生物、免疫、分子遗传系、耶鲁大学生物统计系进行短期访问。主要的研究领域为数据挖掘，机器学习，生物信息学，教育大数据，数据管理等。中国计算机学会高级会员，美国ACM会员，兼任中国计算机学会数据库专业委员会委员、中国计算机学会生物信息学专委会委员、陕西省计算机教育学会副理事长、国家留学人员回国资助项目评审专家、《Frontiers of Computer Science》青年AE、《IJDBB》编委、多个国际学术会议的分会主席和程序委员。作为项目负责人先后主持了国家自然科学基金重点项目（2项），国家自然科学基金委面上项目、青年项目（多项），国家重点研发计划子课题，工信部归国人员择优资助项目等多项课题，作为主要完成人参与了973课题、国家自然科学基金重大国际合作项目等。已在《Cell Reports》、《Molecular and Cellular Biology》、《Scientific Reports》、《Bioinformatics》、《BMC Medical Genomics》、《BMC Bioinformatics》、ICDM、BIBM等国内外重要学术期刊及权威国际学术会议上发表论文70余篇，其中3篇入选ESI热点论文，2篇入选ESI高倍引论文。
